Batsch sinh ra tại Jena, Đức, cha là George Lorenz Bratsch và mẹ là Ernestine (nee Franke) Bratsch. Ông theo học tại trường của thành phố, và sau đó là qua gia sư riêng. Ông cho thấy sự quan tâm của mình đến các môn tự nhiên, và sau cùng ông theo học Đại học Jena (hiện tại là Đại học Friedrich Schiller, Jena), vào năm 1772 và đạt được bằng tiến sĩ vào năm 1781.[1] Batsch kết hôn vào năm 1787 với Amalie Pfaundel. Họ có ba con, Friedrich (sinh năm 1789), George Friedrich Karl (1792), và Karoline (1795). Ông mất năm 1802 sau một khoảng thời gian ngắn mắc bệnh.

Năm 1786, ông đạt được bằng tiến sĩ về y khoa, và bắt đầu dạy lịch sử tự nhiên tại đại học trong cùng năm đó.

Năm 1787, ông bắt đầu dạy y khoa tại đại học. Năm 1792, ông trở thành Giáo sư Triết học. Ông đã từng hướng dẫn Johann Wolfgang von Goethe trong nghiên cứu thực vật học.

Năm 1790, Batsch thành lập vườn thực vật tại Jena, và Naturforschende Gesellschaft ("Câu lạc bộ nghiên cứu tự nhiên").[2]